Este estudo tem como objetivo identificar a comunidade perifítica e suas respostas a mudanças abióticas no abastecimento público de reservatórios de água no município de Araraquara-SP (Ribeirão das Cruzes e Córrego Águas do Paiol). A fim de avaliar as condições desses estoques procedeu-se à identificação do gênero e espécies de fitoplâncton presentes nas fontes supracitadas, além de monitorar os parâmetros físico-químicos in situ e nutrientes totais durante a estação chuvosa e seca. Os resultados mostraram que durante a estação chuvosa em ambas as fontes houve um aumento nas concentrações de fósforo e nitrogênio total, associado ao transporte de material alóctone pelas chuvas. No entanto, o aumento de nutrientes na coluna de água não foi suficiente para alterar a qualidade da água nos locais, uma vez que ambos os reservatórios apresentaram condições oligotróficas nos períodos estudados. A composição da comunidade perifítica, refletiu as boas condições de água nos dois reservatórios, com predomínio de espécies da classe Zygnematophyceae, bons preditores de ambientes oligotróficos e com baixa carga de poluição. No entanto, o trabalho enfatiza a importância da recuperação da cobertura vegetal na microbacia das nascentes estudadas, como uma medida conservacionista desses recursos, uma vez que a expansão das áreas urbanas e agrícolas no município vem se intensificando.