Pigmentos de algas são utilizados amplamente em oceanografia sendo que um dos mais importantes índices, o da biomassa do fitoplâncton, baseia-se na determinação da clorofila a (cia a). Diferente de vegetais superiores, uma das características das algas do plancton é a existência de uma grande diversidade de pigmentos, chamados acessórios ou fotossintéticos, que estão distribuídos entre as diferentes classes. Estes pigmentos incluem clorofilas, carotenóides e ficobiliproteínas. O valor destes pigmentos como ferramenta para estudos filogenéticos, taxonômi¬cos, fisiológicos, ecológicos e outros é grande. Embora a determinação de cla a seja relativamente fácil, a determinação de carotenôides é complexa, dado que estes tem seus máximos de absorção próximos, em torno de 450 nm, e por não possuirem fluorescência. Porém, nos últimos anos, com desenvolvimento de novos materiais e métodos, a técnica de cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE) tem sido utilizada amplamente para a determinação de pigmentos fotossintéticos em oceanografia. No presente trabalho, são apresentados resultados da separação por CLAE de pigmentos fotossintéticos de 6 representantes de grupos diferentes de algas (dinoflagelados, algas verdes, criptomônadas, primnesiofitas, diatomáceas, e cianof ítas). Os pigmentos foram identifi¬cados por meio de seu tempo de retenção e de suas caraterísticas espectrais, em comparação com a composição de pigmentos de algas documentada na literatura. Um total de 19 pigmentos foram identificados. A aplicação da técnica é demonstrada na análise de 3 amostras naturais.