Embora grandes avanços tenham sido realizados nas pesquisas sobre matéria programável a comunicação e automação das partículas que a compõem foi pouco explorada. Este trabalho propôs o desenvolvimento de um sistema de comunicação com o uso de agentes para obtenção da forma desejada de partículas de matéria programável de maneira autônoma. Para tanto, foi criado um ambiente virtual, usando a engine Unity para a realização da simulação de acoplagem das partículas. A validação do funcionamento das partículas de matéria programável no ambiente virtual, apresentou um porcentual de sucesso de 80% na obtenção da forma desejada com uma média de 6500 movimentos e um tempo médio de 6 minutos.