Este trabalho teve como objetivo analisar como o Ensino Colaborativo pode ser um suporte efetivo à inclusão escolar dos estudantes público-alvo da Educação Especial no Instituto Federal Baiano. Para isso, foi realizada uma pesquisa exploratória de abordagem qualitativa, na qual os dados foram construídos por meio de entrevistas semiestruturadas com docentes do Atendimento Educacional Especializado do referido Instituto. Os resultados evidenciam desafios para a efetivação do Ensino Colaborativo conforme os moldes apresentados pela literatura, dentro do contexto da Educação Profissional, Científica e Tecnológica, ao mesmo tempo que apresenta iniciativas incipientes de colaboração entre Educação Especial e ensino comum nos campi participantes da pesquisa. As considerações finais destacam avanços importantes na construção de um ambiente mais inclusivo, mas também apontam a necessidade de ajustes na concepção e execução do Ensino Colaborativo dentro do Instituto.